Niektóre adaptacje węży sprawiły, że długie, pozbawione kończyn ciało to narządy wewnętrzne, które są ułożone inaczej niż u innych zwierząt. Na przykład jedno płuco jest zwykle znacznie większe od drugiego. W niektórych wężach mniejsze płuca ledwo funkcjonują.
Zamiast leżeć obok siebie, nerki, jajniki i jądra są ułożone jeden za drugim. Prawy narząd znajduje się zwykle przed lewym i zwykle jest większym z dwóch; te narządy są również wydłużone. Niektóre narządy, takie jak pęcherz moczowy, zostały wyeliminowane.
Ponieważ wąż nie ma kończyn, aby wspierać swój kręgosłup, prawie wszystkie jego liczne kręgi są podobne. Wąż może mieć nawet 400 kręgów, które blokują kręgosłup, a wąż jest niezwykle elastyczny.
Jedna z najbardziej znaczących adaptacji znajduje się w głowie węża. Zamiast solidnych kości szczękowych, wąż ma kości, które są luźno połączone więzadłami i mogą artykułować w sposób, który pozwala zwierzęciu połykać ofiarę o wiele większą niż jego głowa. Zęby węża są przeznaczone tylko do chwytania ofiary i nie mogą żuć. Są luźno ułożone w głowę, łatwo wypadają i są zastępowane przez całe życie zwierzęcia.
