Wady klonowania obejmują zwiększone ryzyko chorób dziedzicznych, brak zróżnicowania genów, etykę i dogmaty religijne z tym związane. Termin klonowanie odnosi się do szeregu procesów stosowanych do produkcji genetycznie identycznych kopii jednostki biologicznej.
Zwiększone ryzyko dziedzicznych chorób wynika z faktu, że wszystkie klony mają te same geny i dlatego mogą być podatne na określony typ choroby. Może to spowodować jedną chorobę wymazującą całą populację. Inną wadą jest brak zróżnicowania genów. Naturalne rozmnażanie zapewnia kombinację różnych genów, dzięki czemu unikalne osobniki.
Debata o klonowaniu przyciągnęła opinie we wszystkich sferach. Na przykład wśród kręgu religijnego pozostaje tematem kontrowersyjnym. Większość rządów nie zgadza się w pełni z klonowaniem w obawie przed reakcją elektoratu.