Ocean Indyjski jest domem dla wielu gatunków rekinów, niektóre niebezpieczne dla ludzi, inne nie. Według Shark Foundation gatunki zamieszkujące te umiarkowane wody to między innymi błękitne rekiny, jedwabiste rekiny, rekiny wielorybie, rekiny żbikowe, rekiny tygrysie, mako-kędzierzawe, wielki młot, młocarnia i biała.
Jednym z bardziej posłusznych i popularnych rekinów jest rekin wielorybi, gatunek uważany za największą rybę na świecie. Wciąż pozostaje tak wiele do zbadania na temat gatunku, co czyni go aktywnym przedmiotem badań. Mogą być oglądane na głębokości nurkowania w niektórych lokalizacjach. Silky rekiny są tak zwane dla gładkiej jakości skóry, cechą, której nie można znaleźć u żadnego innego gatunku rekina. Błękitne rekiny cieszą się łagodnymi temperaturami oceanu i chętnie łowią wszystko, od kałamarnic i ptaków po jeszcze mniejsze rekiny. Oczywiście, Ocean Indyjski jest także domem dla wszystkich pięciu rekinów, które zostały uznane za najbardziej niebezpieczne dla ludzi: wielkiego białego, tygrysa, makaka, żółwia morskiego i rekina byka.
Oprócz wszystkich tych odmian, badanie z 2012 r. wykazało, że na Oceanie Indyjskim mieszkało wiele rzadko obserwowanych rekinów głębinowych, w tym fałszywe i filetailowe. Ogółem National Geographic ogłosiło, że odkryto aż osiem zupełnie nowych gatunków.