Grzyby są korzystne dla ludzi jako źródła pożywienia i stanowią istotne wsparcie dla innych rodzajów żywności. Tworzą ważne leki, a nawet są używane jako biologiczne środki owadobójcze. Są także żywotnymi rozkładnikami lub saprotrofami, które rozkładają organiczne odpady na bardziej użyteczne formy.
Między 80% a 90% drzew i traw nie może przetrwać bez symbiotycznego związku z grzybami w glebie. To sprawia, że grzyby są niezbędne do uprawy dużej większości roślin spożywczych, nawet jeśli nie są spożywane bezpośrednio.
Grzyby mogą również chronić rośliny uprawne, działając jak patogeny na szkodniki. Grzyby, które to robią, ewoluowały, by atakować tylko niektóre gatunki owadów i pozostawić rośliny bez szwanku. Rozrastają się przez ciała owadów i ostatecznie pojawiają się, aby rozprzestrzeniać swoje zarodniki na inne błędy.
Grzyby mają również znaczenie w przetwórstwie spożywczym i są niezbędnymi składnikami niektórych rodzajów sera, a także w produkcji chleba i fermentacji alkoholowej. Niebieskie zabarwienie w niebieskim serze to rodzaj grzyba.
Grzyby są również głównym źródłem antybiotyków, środków immunosupresyjnych, prekursorów sterydów i substancji zatrzymujących krwawienie. Grzyby są przydatne do badań, ponieważ łatwo rosną, podobnie jak bakterie, ale są znacznie bliższe strukturze komórkowej i genetyki dla ludzi.