Naukowcy nie wiedzą dokładnie, dlaczego pterodaktyle wymarły około 65 milionów lat temu. Niektórzy naukowcy uważają, że zmarli w wyniku uderzenia meteorytu, podczas gdy inni uważają, że zmiana klimatu jest winna. Niektórzy naukowcy uważają, że gazami wulkanicznymi były główną przyczyną, zgodnie z ABC Science.
Pterodaktyle lub pterozaury, jak się je nazywa, nie są dinozaurami, chociaż żyły w tym samym czasie. Mimo że potrafią latać, pterozaury nie są przodkami współczesnych ptaków, tak jak dinozaury. Pterozaury różniły się znacznie wielkością. Najmniejszy gatunek miał rozpiętość skrzydeł mniej niż 1 stopę. Natomiast największy gatunek miał rozpiętości skrzydeł wynoszące 30 stóp lub więcej. Pterozaury były mięsożernymi gadami, które jadły owady, gdy były młode, zanim ukończyły ryby i małe zwierzęta. Według Live Science wiele pterozaurów to padlinożercy, którzy żywią się martwymi dinozaurami.
Według portalu About.com wiele osób uważa, że pterozaury nie wymarły, gdy dinozaury. Zamiast tego uważają, że pterozaury nadal istnieją i są widoczne od czasu do czasu. Pośród innych dowodów, tacy ludzie wskazują relacje naocznych świadków i malowidła naskalne, które wydają się przedstawiać uskrzydlone gady. Jednak portal About.com wyjaśnia, że większość naukowców wątpi w te twierdzenia.