Układ odpornościowy utrzymuje homeostazę, zapobiegając zakłóceniu normalnego funkcjonowania organizmu przez patogeny. Osiąga to na różne sposoby, w tym odporność adaptacyjną, gdy organizm napotka nowy patogen, wrodzoną odporność, wydzielając kwasy na skóry i stosowanie błon śluzowych do rozkładania bakterii.
Kilka czynników może zakłócić homeostazę, w tym wirusy i inne mikroorganizmy, które wywołują gorączkę, podnoszą ciśnienie krwi i zmieniają pH krwi. Układ odpornościowy utrzymuje homeostazę, zapobiegając problemom takich mikroorganizmów i zmniejszając ich zdolność do zakłócania normalnego funkcjonowania. Na przykład, w odporności adaptacyjnej, układ odpornościowy pamięta patogen, kiedy po raz pierwszy wchodzi do organizmu. Kiedy po raz drugi wchodzi do organizmu, natychmiast go usuwa, zapobiegając wtórnej infekcji i zaburzając homeostazę.
Istnieje kilka sposobów, w jakie układ odpornościowy chroni organizm, w tym skórę, antygeny i błony śluzowe. Skóra jest pierwszą linią obrony organizmu. Układ odpornościowy promuje pH skóry, które odstrasza niektóre bakterie. Kiedy antygeny napotykają obcą substancję, zapamiętują ją, a następnie wytwarzają przeciwciała, gdy ponownie wejdą do krwioobiegu. W drogach oddechowych znajdują się błony śluzowe i rzęski. Błony śluzowe mają enzymy, które zwalczają patogeny, a rzęski je usuwają.
