Materiał, z którego zbudowana jest ściana komórkowa, zależy od rodzaju organizmu, do którego należy komórka. Rośliny, grzyby, bakterie i archeony mają ściany komórkowe.
Najczęściej ściany komórkowe są związane z roślinami. Ściany komórek roślinnych mają do trzech warstw: środkową blaszkę, pierwotną ścianę komórkową i wtórną ścianę komórkową, różniące się nieco od pozostałych składem. Najbardziej zewnętrzną warstwą jest środkowa lamela, która jest bogata w pektyny i klei sąsiadujące ze sobą komórki roślinne. Pod tą cienką, elastyczną i rozszerzalną pierwotną ścianą komórkową, która składa się z celulozy, hemicelulozy i pektyny. Najbardziej wewnętrzną warstwą jest gruba ściana wtórnej komórki, która składa się z celulozy, ksylanu i lignanu.
W przypadku grzybów ściana komórkowa jest najbardziej zewnętrzną warstwą. Trzy substancje łączą się, tworząc ściany komórkowe grzybów: chitynę, glukany i białka.
Ściany komórek bakterii składają się z peptydoglikanu. Nazywany także mureiną, peptydoglikan składa się z łańcuchów polisacharydowych usieciowanych przez nietypowe peptydy zawierające D-aminokwasy.
Z wyjątkiem jednej grupy metanogenów, archeony mają cztery typy ścian komórkowych i nie mają peptydoglikanu. Pierwszy typ ściany komórkowej składa się z pseudopeptydoglikanu, drugi rodzaj składa się z polisacharydów, trzeci rodzaj składa się z glikoproteiny, a czwarty składa się z białek.
