Jaguary jedzą żółwie, kajmany i inne zwierzęta rzeczne. Jedzą też większą zdobycz jak jelenie, tapiry i kapibary. Ponieważ jaguary mogą wspiąć się na drzewa, mogą również jeść małpy.
Jaguary są jednym z niewielu kotów, które nie mają problemu z wodą. Są potężnymi pływakami i jedzą zwierzęta rzeczne w ramach swojej głównej diety. Są w stanie wspiąć się na drzewa z mocnymi przedramionami i pazurami i zjadać wiele zwierząt żyjących na drzewach, a także wszystko, co znajduje się na ziemi w lesie, poprzez skaczące zasadzki z góry. Jaguary są na tyle elastyczne, że nawet poza rzekami i lasem mogą polować również na łąkach. Zamiast atakować szyję jak większość drapieżników, jaguary wolą ugryźć się w tył głowy, kierując się bezpośrednio do mózgu za pomocą psich zębów. Jest to możliwe tylko dlatego, że jaguary mają jedne z najsilniejszych szczęk wśród zwierząt kotów. Ich zdolność wspinania się pozwala jaguarom nosić zdobycz na wierzchołki drzew, aby trzymać go z dala od innych drapieżników. Jaguary mogą nosić łupem dwa razy większe od siebie drzewa. Są również w stanie zabić zdobycz, aby jeść podczas pływania w przeciwieństwie do wielu innych kotów.