Mikroskopy świetlne ujawniają struktury żywych komórek i tkanek, zgodnie z HowStuffWorks.com. Używając mikroskopów świetlnych, naukowcy znacznie zwiększyli ludzką wiedzę w dziedzinie nauk biomedycznych. Nawet gdy robią postępy w dostępnej technologii, mikroskop świetlny nadal stanowi potężne narzędzie dla naukowców.
Używanie mikroskopów świetlnych wykracza poza próbki biologiczne. Ujawniają również strukturę skał i innych substancji nieożywionych. W przemyśle elektronicznym mikroskop świetlny staje się narzędziem do kontroli półprzewodników w celu zapewnienia jakości.
Jednak mikroskop świetlny nie jest pozbawiony ograniczeń. Grubsze próbki, które nie przepuszczają światła, nie są widoczne pod mikroskopem świetlnym. Ponadto, nawet jeśli mikroskop świetlny obejmuje doskonałe oświetlenie i idealną soczewkę, obiekty o długości mniejszej niż połowa długości fali światła są nieodróżnialne. Zastosowanie światła białego o średniej długości fali 0,55 mikrometra wymaga próbek większych niż 0,275 mikrometra. Linie bliżej niż to połączenie w jedną linię. Okrągłe obiekty o średnicy mniejszej niż to, w najlepszym razie, zamazują, według About.com. Przy użyciu białego światła powiększenie jest ograniczone do 1250x. Niebieskie światło o krótszej długości fali pozwala mikroskopowi optycznemu uzyskać powiększenie do 5000x. Mikroskop elektronowy, choć nie jest mikroskopem świetlnym, pozwala naukowcowi oglądać obiekty niewidoczne w zwykłym mikroskopie świetlnym.