Dokładna przyczyna bliźniąt syjamskich, dokładniej znana jako zrośnięte bliźniaki, nie jest do końca znana. Ponieważ uważa się, że częstość występowania zroślaków jest wyższa w populacjach południowoazjatyckich i afrykańskich niż w populacjach kaukaskich, Science 360 sugeruje, że czynniki środowiskowe lub genetyczne mogą odgrywać pewną rolę w powstawaniu połączonych bliźniąt.
Seattle Children's Hospital, Research and Foundation wyjaśnia, że chociaż czynniki ryzyka, które powodują powstawanie połączonych bliźniąt, nie są dobrze rozumiane, proces, w którym się one tworzą, dzieli się na dwie dominujące teorie. Jak bliźniaki jednojajowe, bliźnięta połączone zaczynają jako pojedyncze, zapłodnione jaja. Podczas formowania identycznych bliźniaków jajo dzieli się na dwie połowy w ciągu dwóch tygodni od zapłodnienia. Według Mayo Clinic, gdy oddzielenie następuje zbyt późno, ponad 13-15 dni po zapłodnieniu, jajo nie jest w stanie ukończyć procesu dzielenia. To powoduje, że dwie połowy są częściowo połączone, co prowadzi do zrośnięcia bliźniąt.
Przeciwna teoria, wyjaśniona przez Seattle Children's Hospital, Research and Foundation, polega na tym, że jajo jest całkowicie oddzielne, ale z nieznanych przyczyn łączy się ponownie. W niektórych przypadkach połączenie między bliźniętami jest stosunkowo proste, a główne struktury i narządy życiowe rozwijają się niezależnie w każdym bliźniaku. W przypadku innych zestawów bliźniaków niektóre lub wszystkie niezbędne organy i struktury ciała są wspólne.
