Podobnie jak w przypadku innych ras psów-zabawek, psy maltańskie mają skłonność do hipoglikemii lub niskiego ciśnienia krwi, więc należy karmić je niewielkimi ilościami wysokiej jakości karmy dla psów o niskiej zawartości dodatków i wypełniaczy przez cały dzień. Najlepiej byłoby, gdyby 40-50 procent codziennych kalorii maltańczyków pochodziło z mięsa.
Maltańskie psy nigdy nie powinny karmić skrawków stołu lub kości. Skrawki stołowe mogą zaburzać ich wrażliwe układy trawienne, podczas gdy gotowane kości mogą rozrywać i uszkadzać ich jelita lub żołądki. Ponieważ maltańskie psy mają delikatne apetyty, niektórzy właściciele wolą domowe posiłki, dążąc do zrównoważenia mięsa, warzyw i skrobi. Korzystnie, 25 do 35 procent kalorii dziennie maltańskiego powinno pochodzić z warzyw parzonych lub surowych. Pozostałe 25 do 35 procent może stanowić biały lub brązowy ryż lub makaron.
Przy zakupie karmy dla psów sugerowane są marki reklamujące umiarkowane ilości tłuszczu zwierzęcego i duże ilości białka. Mokra żywność powinna cechować się wysoką zawartością wilgoci. Większość suchych pokarmów zawiera ziarna jako wypełniacze, co nie jest zalecane, ponieważ mięsożercy jak psy nie potrzebują ziaren. Marki, które nie wykorzystują produktów ubocznych pochodzenia zwierzęcego są idealne. Psy nie powinny być karmione czymś zawierającym soję; udowodniono, że wpływa negatywnie na ich układy endokrynologiczne.