Głębokość kompensacji to poziom, w którym woda morska rozpuszcza kalcyt lub węglan wapnia. W pobliżu oceanu, gdzie woda jest ciepła i pod niskim ciśnieniem, gatunki planktonowe mogą zawierać wapń i węgiel w ich zmineralizowane muszle. Jednak na głębokości kompensacji zimna, kwaśna woda szybko rozpuszcza węglan wapnia.
Głębokość kompensacji jest punktem, w którym woda całkowicie rozpuszcza węglan wapnia i ługuje minerał z dna morskiego. Lysoklina, jak się ją czasami nazywa, w większości obszarów ma od 4 do 5 kilometrów głębokości, chociaż biegnie głębiej, gdy kontynentalne spływy powodują turbulencje i poruszają wszystkie, poza najgłębszymi warstwami oceanu. W miejscach, gdzie mała turbulencja wpływa na warstwy oceanu, głębokość kompensacji jest zwykle wyższa niż średnia.
Kwasowość wody głębokiej wynika z nagromadzenia się CO2 uwalnianego przez gatunki głębinowe zwierząt. Zwierzęta te pobierają tlen z otaczającej wody i wydalają CO2 w taki sam sposób jak inne zwierzęta. Na głębokości jednak CO2 nie może uciec przed wysokimi ciśnieniami i ekstremalnie niskimi temperaturami wody, w której jest zawieszony. Powoduje to, że woda jest znacznie bardziej kwaśna niż wody powierzchniowe i powoduje, że rozpuszcza wapń, który osadza się na skutek stałego opadu wydychanego planktonu z góry . Ponieważ głębokie wody wydobywają kalcyt ze skał, wapień nie może tworzyć się na głębokości. Ta różnica pomaga geologom określić głębokość, z jaką powstały skały na starożytnych dnach.