W naukach geologicznych sedymentacja jest procesem gromadzenia się osadów lub brudu na rafie. Jest to zjawisko naturalne, które wynika z erozji gruntów i raf. Szeroko rozumiana, obejmuje także zlodowacenie lodowe i nagromadzenie materiałów z powodu grawitacji, takie jak złogi kruszców i gromadzenie skał skalnych u podstawy klifów.
Dekompozycja gleby, rozkład roślin, rozkład zwierząt i erozja podłoża są naturalnymi źródłami osadów transportowanych do oceanów. Osady często dodają do gleby substancje odżywcze. Naturalna mobilizacja osadów pomaga rozwijać i utrzymywać siedliska przybrzeżne, takie jak lasy namorzynowe, rafy koralowe, estuaria, laguny i mokradła. Jednak wiele ludzkich działań często zmienia proces sedymentacji i erozji. Wysoka sedymentacja niszczy korale, gdy osady lądują bezpośrednio na wierzchu koralowców, dławiąc korale. Korale nie są w stanie usuwać osadów, ponieważ nie mogą się poruszać. Sedymentacja jest czasami szkodliwa dla koralowców, głównie dlatego, że wpływa na przejrzystość wody i sprawia, że woda jest mętna lub mętna. Kiedy występuje duże zmętnienie, ilość światła docierającego do koralowców jest znacznie zmniejszona. Przy mniejszym świetle korale mają trudności z fotosyntezą. Czynności ludzkie są głównymi sprawcami wzrostu wskaźnika sedymentacji wzdłuż wielu obszarów wybrzeża. Działania te są głównie związane z niewłaściwymi praktykami w zakresie gospodarowania gruntami, takimi jak nieuregulowane korzystanie z pojazdów terenowych i zły rozwój obszarów miejskich.
