Prawie cała objętość atomu jest pustą przestrzenią. Na przykład atom wodoru, który ma jeden proton, jeden neutron i jeden elektron, jest 99,99 procentami pustej przestrzeni, z zaledwie 0,0000000000004 procentami o jego objętości zajmowanej przez cząstki subatomowe.
Aby uzyskać pewną skalę, jeśli atom wodoru byłby wielkości Ziemi, jego jądro pojedynczego protonu i neutronu miałoby około 600 stóp średnicy, pozostawiając resztę Ziemi pustą próżnią. Elektrony, chociaż są około 1800 razy mniej masywne niż protony, mają nieznaną objętość. Cięższe pierwiastki mają więcej cząstek subatomowych, a zatem nieco wyższy stosunek materiału subatomowego do pustej przestrzeni.
