Epidemia ospy przetoczyła się przez Imperium Inków, osłabiając ją w samą porę, by hiszpański konkwistador Francisco Pizarro i jego ludzie i sprzymierzeńcy ją zdobyli. Istnieją również mocne dowody na to, że imperium już się rozpadło , jego infrastruktura została zniszczona przez przeładowanie i rząd przez spory.
Incan Emperor Huayna Capac zmarł na ospę razem ze swoim spadkobiercą, podobnie jak konkwistadorzy nawiązali kontakt z imperium. Ponieważ miał dwóch innych synów, Atahualpa i Huascara, którzy dążyli do tronu, jego śmierć wywołała wojnę domową. Krótko po tym, jak Atahualpa zginął jego przyrodni brat Huascar, Pizarro stracił Atahualpę, a następnie zainstalował swojego własnego króla, nastolatka o imieniu Manco Inca.
Inkowie ponownie wystąpili przeciwko Pizarro, gdy żona Manco Inca została skradziona przez brata Pizarro. Zostały zmiażdżone przez ciężko uzbrojonych Hiszpanów, a rosnące dewastacje ospy zapobiegły dalszemu oporowi.