Wielkie pandy mają ogony, ale na dorosłych często pozostają niezauważone, ponieważ ogony stanowią mniej niż 10 procent całkowitej masy ciała dorosłego. Ogon dorosłej pandy jest często schowany blisko ciała, co utrudnia dostrzeżenie.
Okrężny gruczoł u podstawy gigantycznego panda wydala substancję o kwaśnym zapachu. Ogromna panda używa swojego ogona, aby rozsmarować tę substancję i jej zapach na pniach drzew, ścianach i innych powierzchniach, aby oznaczyć jej terytorium. Samica olbrzymia panda może również użyć swojego ogona, aby oznaczyć obszar z zapachem, aby wskazać, że jest gotowa do kojarzenia.