Niektóre protisty mają ściany komórkowe, ale inne nie. Protists ze ścianami komórkowymi to fotosyntetyczne okrzemki, czerwone algi i zielone algi oraz grzybopodobny Oomycota. Większość innych protistów, takich jak brązowe glony i zwierzęce protisty, nie ma.
Różne grupy protistów mają ściany komórkowe złożone z różnych materiałów. Zielone algi i Oomycota mają ściany komórkowe wykonane przynajmniej częściowo z celulozy, podobnie jak komórki wokół komórek roślinnych. Czerwone algi mają także celulozę w ściankach komórek, ale ściany zawierają również węglan wapnia. Okrzemki, które są głównym składnikiem ziemi okrzemkowej, mają ściany komórkowe wykonane z krzemionki.
