Wyprawa hiszpańska, do której Balboa przyłączył się do Ameryki Południowej, składała się z dwóch statków: Santa Maria i San Anton. Balboa przeprowadziła inne ekspedycje, ale nazwy statków są niepewne.
Hiszpańska wyprawa Balboa dołączyła do zgromadzonego w 1501 roku skarbu, ale oba statki zostały zatopione w 1503 roku z powodu szkód spowodowanych wcześniej przez robaki Teredo. Statki były zbyt zniszczone i nie mogły przetrwać burzy, więc zatonąły, a część skarbu, które zebrali, została utracona. Podczas późniejszej wyprawy Balboa popłynął statkiem zwanym Rolling Wind, ale rok wyprawy jest niepewny.