Pies preryjny stał się zagrożony głównie z powodu utraty siedlisk z rozwoju miejskiego i rolniczego. Istnieje kilka gatunków psów preriowych, z których każda stoi w obliczu zagrożenia z różnych przyczyn, w tym zarazy.
Pies preryjny z czarnym ogonem niemal wyginął, począwszy od 2014 roku. Został doprowadzony do tego stanu głównie z powodu braku odporności na zarazę. Pies pręgowany Gunnison został zagrożony przez dżumę, rozwój ziemi i odwierty gazu i ropy. Utrata siedlisk dla rolnictwa zagraża meksykańskiemu preryjnemu psu. Pies preryjny w stanie Utah stał się zagrożony wypasem zwierząt hodowlanych, zarazy i utratą siedlisk. Począwszy od 2010 r., USA Ryby & Wildlife Service odmówiła ochrony przed białym ogonem preriowych psów zgodnie z ustawą o zagrożonych gatunkach.
