Przyciski brzucha pachną, gdy są zainfekowane. Ciepła, wilgotna szczelina oferowana przez pępek jest miejscem sprzyjającym rozwojowi bakterii i grzybów. Zapach i wydzielina prawie zawsze oznaczają infekcję. Mycie pępka i utrzymywanie go w suchości może zapobiec infekcjom.
Czasami do leczenia infekcji należy stosować kremy przeciwbakteryjne lub przeciwgrzybicze. Niekontrolowana cukrzyca jest czynnikiem predysponującym do rozwoju infekcji guzków pępka.
Stan medyczny zwany urachusem patentowym może również wywoływać nieprzyjemny zapach z pępka. W urachusie opatrywanym przez rurkę łączącą pęcherz z pępowiną u niemowląt nie zamyka się po urodzeniu. To otwarte połączenie może prowadzić do zapachu, infekcji i wypływu z pępka. Operacja jest konieczna, aby poprawić urachus patentowy.
