Wenecja tonie, ponieważ adriatycki talerz pod miastem upada pod górami Apeninów z powodu tektoniki płyt i powolnego zagęszczania osadów wspierających miasto. Jeden lub oba te procesy są również powodując lekkie nachylenie miasta na wschód. Historycznie rzecz biorąc, pompowanie wody gruntowej spod miasta również przyczyniło się do zatonięcia, ale takie pompowanie zostało zatrzymane.
Wenecja tonie w tempie około 0,08 cala rocznie. Poziom morza wokół Wenecji rośnie prawie w tym samym tempie, co nasila problem. Zanikają zarówno miasto, jak i kraina okolicznych lagun. Pomiary satelitarne z lat 2000-2009 wykazały, że zatonięcie ustało po ustaniu pompowania wód gruntowych, ale kolejne techniki GPS wykazały, że miasto nadal tonie.
W wyniku zarówno zatonięcia miasta, jak i podniesienia się poziomu mórz, powodzie coraz częściej pojawiają się w Wenecji. Chodniki desek muszą być teraz używane kilka razy w roku, aby umożliwić mieszkańcom poruszanie się po dużych częściach miasta. Podstawowym rozwiązaniem, które obecnie znajduje się w zakładzie, jest szereg bramek, zaprojektowanych do utrzymywania wody podczas przypływów.
