Mocznik w ludzkim ciele jest wytwarzany w wątrobie, wykorzystując swój system enzymów i cząsteczek nośnika do przekształcania wysoce toksycznego amoniaku i dwutlenku węgla w mocznik. Można go następnie bezpiecznie usunąć z organizmu nerki.
Mocznik jest głównym produktem końcowym metabolizmu azotu u ludzi i ssaków. Mocznik, choć nie tak toksyczny jak amoniak, nie może być tolerowany przez organizm w dużych ilościach. Problemy z cyklem mocznika mogą szybko stać się śmiertelne. Marskość wątroby, która może być spowodowana alkoholizmem, może powodować ingerencję w enzymy wytwarzające fosforan karbamylu w pierwszym etapie cyklu.