Atom wodoru ma jeden elektron. Atom wodoru składa się po prostu z jednego elektronu i jednego protonu, które są połączone przez siłę elektromagnetyczną.
Aby atom wodoru istniał, musi mieć zarówno elektron, jak i proton. Elektron ma ładunek ujemny, a proton ma ładunek dodatni, a ładunki te działają przeciwko sobie nawzajem w celu wytworzenia siły elektromagnetycznej, która utrzymuje cały atom razem. Nieustannie pracują przeciwko sobie, ponieważ jeden jest dodatni, a drugi ujemny, ale ich odpychanie sprawia, że atom wodoru istnieje. Czasami elektron ucieka z protonu, a wodór staje się dodatnio naładowanym jonem. Atom wodoru jest w stanie zlokalizować nowy elektron, gdy tak się stanie.
W przeszłości nierzadko zdarzało się, że atomy wodoru pokazywano jako bardzo duży proton z bardzo małym elektronem na krawędzi atomu. Podczas, gdy było to łatwe dla ludzi do wizualizacji, nie była to dokładna reprezentacja. Proton jest znacznie silniejszy niż elektron, ale niekoniecznie jest większy od niego. Elektron jest teraz pokazany jako siła, która hermetyzuje cały atom i tworzy większość atomu, zamiast być prostą plamką siedzącą na krawędzi atomu.
