Nietoperze na wolności żyją średnio od 10 do 20 lat. To zależy od przetrwania do dorosłości; młode nietoperze mają wysoką śmiertelność. Po pierwszych trzech tygodniach życia uczą się latać, co zwiększa ich szanse na przeżycie.
Poszczególny nietoperz z gatunku małego nietoperza, Myotis lucifugus, żył prawie 40 lat, co jest znacznym odstępstwem od średniej długości życia nietoperzy. Biolodzy zasadniczo zgadzają się, że nietoperze przeżywają inne ssaki o porównywalnej wielkości, takie jak gryzonie i naczelne. Nietoperze są podatne na niektóre drapieżniki i pasożyty grzybowe, takie jak Pseudogymnoascus destructans, który prawdopodobnie powoduje chorobę zwaną syndromem białego nosa.
