Głębokość pępka zmienia się wraz z wielkością i kształtem osoby. Osoba o dużym obwodzie często ma głębszy pępek niż ktoś mniejszy. Oznacza to również, że głębokość pępka osoby czasami zmienia się z czasem.
Pępek to blizna pozostawiona po zerwaniu pępowiny po urodzeniu. Guziki na brzuchu, podobnie jak odciski palców, są wyjątkowe. Różnice w rozmiarze, kształcie i głębokości występują również w trakcie życia jednostki. W miarę jak ludzka tkanka rozciąga się lub kurczy, tak samo dzieje się z pępkiem. Poród często zmienia również kształt i głębokość kobiecego pępka.