Wytyczne federalne i stanowe zawierają przepisy dotyczące przechowywania butli z tlenem, w których stwierdza się, że cylindry powinny być przechowywane w racku i przechowywane z dala od środków łatwopalnych. Butle tlenowe są stosowane w przemyśle, edukacji, medycynie i obszarach konsumenckich i zawsze należy obchodzić się z nimi ostrożnie.
Butle tlenowe są niebezpieczne ze względu na ciśnienie wewnątrz nich. Powinny być zawsze przechowywane w pozycji pionowej i bezpiecznej, ponieważ upadek może uszkodzić zbiornik, może spowodować pęknięcie lub może spowodować, że zbiornik stanie się zagrożeniem powietrznym. Tlen wewnątrz butli może być bardzo zimny, szczególnie jeśli gaz ma być używany do celów kriogenicznych lub zamrażania. Gazy takie powodują, że skóra i inne materiały stają się bardzo kruche i mogą powodować obrażenia podobne do oparzeń termicznych.
Butle z tlenem należy przechowywać z dala od łatwopalnych źródeł, ponieważ ich zawartość może się zapalić. Tlen nie powinien być również przechowywany w tej samej przestrzeni z innymi zbiornikami łatwopalnych gazów lub cieczy. Ponadto przepisy federalne i stanowe zawierają jasne wytyczne dotyczące tego, ile zbiorników można przechowywać w jednym obszarze. Poszczególne zbiorniki do celów leczniczych mają podobne zagrożenia i powinny być traktowane zgodnie z tymi samymi środkami ostrożności.
Zbiorniki z tlenem powinny być przechowywane w pomieszczeniach do tego przeznaczonych. Pomieszczenie powinno mieć wystarczającą powierzchnię do przesuwania cylindrów i powinno być zabezpieczone drzwiami blokującymi. Pomieszczenie musi spełniać odpowiednie wymagania przeciwpożarowe, wymagania dotyczące wentylacji i przepisy budowlane. Regały używane do zabezpieczania zarówno napełnionych, jak i pustych zbiorników muszą spełniać podobne wymagania kodowe.