Ponieważ sowy jedzą swoją ofiarę w całości, wymagają specjalnego układu trawiennego składającego się z dwu komorowego żołądka: gruczołowego żołądka i żołądka. Kiedy sowa pożera ofiarę, ofiara najpierw przechodzi do gruczołowego żołądka, gdzie kwasy i enzymy zaczynają rozkładać tłuszcz, mięśnie i narządy wewnętrzne.
Następnie pokarm przechodzi do żołądka, które zasadniczo działa jak miejsce przechowywania wszystkich materiałów, których kwasy żołądkowe nie trawią, takich jak pióra, włosy, zęby i kości. Pozostałe częściowo strawione tkanki są następnie filtrowane i trafiają dalej do jelita cienkiego, gdzie enzymy rozkładają je dalej wraz z substancjami odżywczymi wchłanianymi do organizmu. Częściowo strawione tkanki przechodzą następnie do jelita grubego, zanim ostatecznie dotrą do kloaki, gdzie są przechowywane wraz z odpadami z układu moczowego. Odpady są mieszane z mocznikiem i ostatecznie uwalniane z kloaki przez otwór wentylacyjny sowy.
Podczas gdy to wszystko się dzieje, niestrawny materiał pozostaje w żołądku, gdzie jest powoli kompresowany do peletki, która ma taki sam kształt i rozmiar jak żołądek. Po tym, jak żołądek zagęszcza peletkę, pelet następnie wraca do gruczołowego żołądka, gdzie może być przechowywany przez 10 godzin, zanim sowa w końcu odzyska je z powrotem. W tym czasie sowa nie może jeść, ponieważ pelet blokuje wejście do układu pokarmowego.
