Pogoda biomów słodkowodnych różni się w zależności od rodzaju ekosystemu; Stawy i jeziora cieszą się umiarkowanymi temperaturami z sezonowymi zmianami, podczas gdy tereny podmokłe na ogół występują w cieplejszych, wilgotnych obszarach. Niektóre większe zbiorniki wodne w biomach, takich jak jeziora i duże stawy, wpływają na temperaturę powietrza otaczającego i poziom wilgotności przez ciepło i podgrzewać energię do otaczającego powietrza. Inne, takie jak małe rzeki i strumienie, czerpią wpływ ze swoich środowisk, zmieniając się w formie fizycznej i temperaturze w zależności od lokalnych warunków.
Pogoda w biomach słodkowodnych różni się w zależności od pór roku i lokalizacji geograficznej. Niektóre stawy i jeziora występują sezonowo, wypełniając naturalne łóżka dużymi wiosennymi i letnimi opadami. Dodatkowa wilgoć wyparowuje w powietrzu, obniżając temperaturę i wytwarzając lokalne warunki, takie jak mgła i mgła. Temperatura wody w tych ciałach wodnych zmienia się wraz z porami roku, zmieniając skład fizyczny. Zimna woda tworzy lód w niektórych jeziorach i stawach zimą, zmniejszając aktywność organizmów.
Temperatura i warunki strumieni i rzek zmieniają się, zmieniając się wraz z porami roku i lokalizacją. Źródła strumieni, które często pobierają wodę z głębi Ziemi, mają niższą temperaturę niż usta. Strumienie i rzeki pojawiają się na całym świecie, występując w zimnym, północnym klimacie, umiarkowanych warunkach i ciepłych, wilgotnych miejscach.
