Belgijski Malinois jest zupełnie inną rasą psów niż owczarek niemiecki, ale czasami uważa się, że są takie same ze względu na ich podobny wygląd. Malinois i owczarki niemieckie mają wiele różnic: w tym pochodzenie, rodzaj sierści, potencjalne kolory i zwyczaje.
Najbardziej zasadniczą różnicą między dwiema rasami jest ich pochodzenie, ponieważ każdy pochodzi z kraju w ich imieniu. Podczas gdy dwie rasy czasami wyglądają podobnie, istnieją subtelne różnice w ich wyglądzie. Malinois ma cienką lub drucianą powłokę, podczas gdy owczarki niemieckie mają średni płaszcz. Obie rasy mogą być czarne lub brązowe i czarne, ale Malinois może być również szare, podczas gdy owczarki niemieckie mogą być białe. Dodatkowo, Malinois rzuca się tylko sezonowo, podczas gdy owczarek niemiecki będzie się rzucał nieprzerwanie przez cały rok.
Belgijskie malinois są prawie wyłącznie hodowane jako psy pasterskie, podczas gdy owczarki niemieckie mogą być psami pasterskimi lub pracującymi. Owczarki niemieckie mają nieco niższą średnią długość życia, ale mają taką samą maksymalną długość życia wynoszącą 13 lat. Owczarki niemieckie mają również niższy minimalny i wyższy ciężar maksymalny. Wreszcie, chociaż psy mają bardzo podobny ogólny temperament, belgijscy Malinois nie są zbyt skłonni do bycia ochronnymi, podczas gdy owczarki niemieckie nie są skłonne do reagowania lub niezależności.