Grzyby są heterotrofami, co oznacza, że spełniają swoje potrzeby w zakresie węgla i energii, rozkładając i przyswajając materię organiczną. Grzyby są w stanie wchłaniać i metabolizować wiele różnych węglowodanów, w tym glukozę, ksylozę i fruktoza. Trudniejsze węglowodany są również łatwo trawione, takie jak celuloza i hemiceluloza.
Grzyby wykorzystują enzymy do rozbijania materiałów, na których rosną. Podczas wchłaniania trawionego materiału, żywność musi być w postaci roztworu, aby dostać się do ścian strzępek grzybów. Saprobowe grzyby i bakterie są w dużej mierze odpowiedzialne za większość organicznego rozkładu. Ogólnie rzecz biorąc, grzyby potrzebują tlenu, aby przeżyć, ale są również w stanie wykorzystać fermentację, gdy brakuje tlenu.