Różne stawonogi mają różne układy oddechowe. Niektóre mają skrzela, w których odbywa się wymiana gazowa, a inne mają układ oddechowy tchawicy. Każdy układ oddechowy działa nieco inaczej.
Tylko te stawonogi, które żyją w wodzie, mają skrzela. Skrzela tych zwierząt działają w taki sam sposób, jak skrzela ryby, zapewniając wymianę gazów, która pozwala zwierzętom przyjmować tlen.
Stawonogi lądowe mają system tchawicy, który jest niewielkim kanałem powietrznym, który znajduje się w całym ciele zwierzęcia. Stawonogi mają możliwość otwierania i zamykania tych kanałów powietrznych, aby w razie potrzeby oszczędzać wodę.
