Fermentacja zachodzi w komórkach, gdy brakuje tlenu. Tlen jest wykorzystywany w procesie wytwarzania energii potrzebnej do funkcjonowania komórki. Dwa rodzaje fermentacji to fermentacja mlekowa i fermentacja alkoholowa.
Zwierzęta i niektóre rodzaje bakterii mogą wykorzystywać fermentację kwasu mlekowego do produkcji energii. Komórki mięśniowe wykorzystują fermentację kwasu mlekowego podczas ćwiczeń, gdy nie ma wystarczającej ilości tlenu, aby zapewnić zwiększoną energię potrzebną do skurczów mięśni. Produktem odpadowym tego procesu jest kwas mlekowy. Kwas mlekowy musi być usunięty z organizmu przez wątrobę. Fermentacja alkoholowa występuje również bez użycia tlenu. Oprócz energii, fermentacja alkoholowa prowadzi do powstania produktu odpadowego o nazwie etanol.