Kamienie naturalne to minerały lub kamienie, które nie zostały sztucznie stworzone. Często używane do biżuterii lub ozdoby, zazwyczaj muszą być polerowane i cięte, zanim zostaną uznane za klejnot jakości.
Wiele klejnotów tworzy się głęboko w skorupie i płaszczu Ziemi pod wpływem ekstremalnych upałów i nacisków. Należą do nich diamenty i czerwone granaty. Skały zawierające te potencjalne klejnoty docierają do powierzchni albo przez podwyższenie podczas formowania się gór, przez operacje wydobywcze, albo przez magmy wznoszące się z ziemi. Kiedy magma dociera do powierzchni Ziemi w postaci lawy i chłodzi, wietrzenie może ją rozbić i odkryć klejnoty w środku. Właśnie dlatego w Himalajach znaleziono klejnoty takie jak rubiny i jadeit, choć ukształtowane w głębi ziemi.
Klejnoty pochodzą również z górnej części skorupy ziemskiej, gdzie ciśnienia są niższe, a temperatury mogą się różnić. Stąd pochodzą klejnoty takie jak granat, andaluzyt i lapis lazuli.
Podczas ostatniej fazy krystalizacji granitu można skoncentrować pierwiastki takie jak bor, beryl i lit. Te elementy tworzą klejnoty, takie jak szmaragd, turmalin i topaz.
Niektóre rodzaje klejnotów nie pochodzą z wnętrza ziemi, ale z żywych stworzeń. Należą do nich perły, koral, bursztyn i dżet.
