Odpady rolne mogą wywoływać szereg szkodliwych skutków, w tym zagrożenie dla zdrowia i skażenie okolicznych zbiorników wodnych i atmosfery. Odpady z rolnictwa, jeśli nie zostaną odpowiednio zutylizowane, mogą powodować skutki krótkoterminowe i długoterminowe o ekosystemach, glebie i szerszych środowiskach poprzez wprowadzanie obcych toksyn do gleby i wody.
Zanieczyszczenia rolnicze pochodzą z kilku źródeł. Pestycydy i nawozy stanowią większość odpadów rolniczych i obejmują wytworzone przez człowieka syntetyczne chemikalia i materiały. Związki syntetyczne często nie ulegają biodegradacji po wystawieniu na działanie powietrza lub wody i mogą utrzymywać się przez dekady, a nawet stulecie. Te chemikalia są rozpylane na polach uprawnych, aby powstrzymać owady i przedostawać się do strumieni i dróg wodnych jako odpływ. Zanieczyszczona woda jest kolejnym głównym efektem odpadów rolniczych; woda zostaje zanieczyszczona przez nawóz i resztki pestycydów, wraz z patogenami, takimi jak wirusy i bakterie, które mogą przedostać się do systemów wody pitnej. Według Conserve Energy Future zanieczyszczenie rolnictwa jest głównym źródłem zanieczyszczenia wody i jezior, ponieważ substancje chemiczne i toksyny przedostają się do wód gruntowych po osiedleniu się na dnie tych dużych zbiorników wodnych. Nagromadzenie tych substancji ostatecznie prowadzi do problemów zdrowotnych, takich jak zespół niebieskiego dziecka i dolegliwości neurologiczne. Odpady rolnicze mogą również negatywnie wpływać na wodne zwierzęta i rośliny, ponieważ nawozy, obornik, amoniak i odpady trafiają do lokalnych środowisk i zakłócają procesy ekosystemowe.
