Głównymi drapieżnikami jeżyny są kojoty i bobki, które lubią swój duży rozmiar ciała i duży zapas mięsa. Niektóre wilki i sowy również polują na jeżozwierza. W porównaniu do innych gryzoni, jeżozwierze mają niewielką liczbę wrogów, ponieważ inne zwierzęta nie lubią zajmować się swoimi ostrymi piórami.
Ludzie stanowią jedno z największych zagrożeń dla jeżozwierzy. Wiele jeżozwierze ginie na drogach, gdy trafią je pojazdy mechaniczne. Niektórzy ludzie polują na jeżyny w poszukiwaniu jedzenia. Ponieważ jeżozwierze powoduje uszkodzenia drzew, sadzonek, roślin uprawnych, opon i linii energetycznych z powodu ich aktywności żucia, ludzie uważają je za szkodniki i używają pułapek lub zatruć, aby je wyeliminować.
