Naturalne zasoby Missouri obejmują ołów, cynk, rudę żelaza, dolomit, baryt, wapień, miedź, granit, marmur, piaskowiec, glebę do działalności rolniczej oraz liczne jeziora i rzeki. Missouri produkuje 90% nierecyklicznej ołowiu w Stanach Zjednoczonych, stan na sierpień 2014. Produkty rolne obejmują soję, kukurydzę, siano, bydło, indyki i kurczęta.
Missouri ma ponad 300 kopalń, odpowiedzialnych za 8 miliardów dolarów działalności gospodarczej od sierpnia 2014 r. W kopalniach Missouri zatrudnionych jest ponad 30 000 osób. Missouri jest czołowym państwem produkującym ołów, a 80 procent ołowiu wydobytego w Missouri trafia do akumulatorów samochodowych. Missouri jest również numerem jeden wśród producentów wapna w Stanach Zjednoczonych, z których większość trafia do produkcji cementu. Stan Show-Me jest trzeci w cynku, piąty w miedzi i szósty w srebrnym wydobyciu wszystkich 50 stanów.
Szlaki wodne w Missouri obejmują rzeki takie jak Missouri, Mississippi, Platte, Osage, Meramec, Gasconade, St. Francis and Current. Największe jeziora w stanie, z których wszystkie są sztuczne, obejmują jezioro Ozarks, Table Rock, Stockton i Bull Shoals.
Główne gatunki ryb w jeziorach i rzekach stanu to sum, pstrąg, bas, crappie, walleye i okoń. Najmniejszy gatunek ryb w Missouri jest najmniej przepasany na 1,5 cala, a największy to ogromny paddlefish o wadze ponad 100 funtów.
