Negatywne aspekty energii z biomasy są podobne do tych związanych z wykorzystaniem paliw kopalnych do wytwarzania energii elektrycznej, z wyjątkiem tego, że paliwa z biomasy są odnawialnymi źródłami energii. Palenie paliw z biomasy powoduje obawy związane z emisjami i zużycie wody. Paliwa z biomasy są mniej wydajne i wymagają więcej ziemi.
Energia biomasy wykorzystuje paliwo ze źródeł roślinnych i zwierzęcych. Źródłami tymi są odpady, takie jak wióry drzewne, ścieki, obornik i zgniłe drzewa, ale także rośliny uprawiane specjalnie na potrzeby konwersji biomasy. Podczas gdy ludzie używali drewna od wieków jako źródła ciepła, energia z biomasy wykorzystuje to źródło paliwa do zasilania silników lub elektrowni. Jednak tworzenie źródła paliwa jest często kosztowne, nawet jeśli zużywa produkty odpadowe.
Podczas gdy energia z biomasy przyczynia się do redukcji emisji dwutlenku węgla, zwiększa ona inne gazy cieplarniane, w tym metan. Z punktu widzenia ochrony środowiska emisje z zakładu produkującego biomasę są tak samo szkodliwe, jak emisje z paliw kopalnych. Wykorzystanie odpadów ze zwierząt i ludzi powoduje również powstawanie niepożądanych zapachów.
Ponieważ energia z biomasy wytwarza metan, wymaga więcej ziemi niż innych rodzajów produkcji energii, aby chronić ludzi żyjących w pobliżu rośliny. Jeśli zapotrzebowanie na dodatkową biomasę przekracza dostępne produkty odpadowe, istnieje możliwość przejścia rolników z upraw żywności na uprawy biomasy, co zmniejsza dostępność żywności. Popyt ma również potencjał, aby stawić dalsze wymagania na już zestresowane lasy.
