Zwierzęta, takie jak nietoperze, delfiny, szczury, wieloryby i ptaki oleiste, używają ultradźwięków do nawigacji lub komunikowania się. Nietoperze, delfiny i niektóre zębate wieloryby wykorzystują echolację, technikę ultradźwiękową, która wykorzystuje echa do identyfikacji i znajdź obiekty. Echolacja pozwala nietoperzom poruszać się po ciemnych jaskiniach i znaleźć owady na jedzenie.
Delfiny i wieloryby emitują szybki szereg podwodnych kliknięć w częstotliwościach ultradźwiękowych, aby zlokalizować swoją ofiarę i poruszać się po wodzie. Męskie myszy i szczury wykorzystują ultradźwiękowe wokalizacje jako pieśń zalotów, aby przyciągnąć kobiety. Wiele nocnych owadów, w tym ćmy, koniki polne, modliszka, chrząszcze i szarańcza, mają ostry ultradźwiękowy słuch, który pomaga im uciec przed drapieżnikami. Podczas gdy ptaki-ptaki używają ultradźwięków do bezpiecznego latania i polowania w nocy, używają niższych częstotliwości echolokacji w porównaniu do nietoperzy i innych nocnych owadów.