Ocean Indyjski, podobnie jak wiele ziemskich oceanów, służy jako dom dla wielu różnych gatunków, w tym bezmózgowców, rekinów białych, delfinów butlonosych, błękitnych wielorybów, żółwi morskich, meduz, płaszczek, ukwiałów, morza węże, robaki i kamienne rybki. Stworzenia zamieszkujące obszar Oceanu Indyjskiego od drobnych mikroorganizmów po największe zwierzęta na świecie, takie jak duże rekiny i błękitne wieloryby. Niektóre stworzenia stanowią niewielkie zagrożenie dla ludzi i innych ssaków, podczas gdy inne zawierają śmiertelny jad lub wydzielają silne toksyny, potencjalnie powodując szkody.
Zwierzęta na Oceanie Indyjskim obejmują wiele głównych grup, w tym organizmy ciepłokrwiste i zimnokrwiste, skorupiaki, ryby i skorupiaki. Niektóre, jak kamienna ryba, portugalska Man-O-War, muszle i stożki wydają się być atrakcyjnymi i łagodnymi organizmami, ale gromadzą śmiertelne trucizny. Portugalski Man-O-War, który tworzy się z kolonii polipów, zawiera długie, parzące macki. Mają pewne podobieństwo do Pokrzywy Morskiej, potencjalnie niebezpiecznej, bladej różowej meduzy.
Podczas gdy te zwierzęta żyją na głębszych wodach, inne znajdują się bliżej linii brzegowej i raf. Na przykład ryby ze strzyków, anenomefish, lionfish i Blue Devils preferują płytkie wody. Stonefish wtapiają się w otoczenie z zewnętrzną skórką w kolorze piasku. Clown anenomefish zawierają krew ze śmiercionośnymi toksynami; w przeciwnej taktyce przetrwania, mają odważne i piękne kolory, ostrzegając przed drapieżnikami o ich toksyczności. Inni mieszkańcy Oceanu Indyjskiego to mureny, kilka gatunków promieni i barakudy.