Aligatory w rzeczywistości nie oddychają pod wodą. Choć mogą pozostawać zanurzone przez dłuższy czas, muszą w końcu wydostać się na powierzchnię, by oddychać przez nozdrza na ich długich pyskach.
Wśród wielu udanych adaptacji, które pozwoliły aligatorom pozostać w dużej mierze niezmienione przez tysiące lat, jest możliwość pozostania zanurzonym przez ponad godzinę na raz. Ta umiejętność jest wspomagana przez serce aligatora, które zwalnia, kiedy zwierzę zanurza się, pozwalając ciału na bardziej efektywne wykorzystanie tlenu. Brak oddychania w wodzie jest niezbędny dla przetrwania aligatora. W rzeczywistości ten duży gad zaadaptował klapy na nos, które zaciskają się i blokują dostęp wody, gdy gator nurkuje pod wodą.