Wulkanizacja pochłania wchodzące materiały energetyczne przez endocytozę. Lizosomy przyłączają się do tych organelli, łącząc się, gdy enzymy trawią zawartość wakuoli. Lizosomy i wakuole działają razem, tworząc układ trawienny dla komórki eukariotycznej.
Materia używana w produkcji energii - taka jak skrobie, tłuszcz i glikogen - wchodzi do komórki poprzez endocytozę. Próżnia powstaje w wyniku tego procesu ściągania z zewnętrznej membrany komórki. Kiedy wakuola otacza materię, staje się endosomem. Otoczony własną błoną komórkową, endosomy przechowują materiały komórkowe, aż będą gotowe do przetworzenia przez lizosomy.
Podczas gdy struktura jest wytwarzana przez ciało Golgiego, silne enzymy są wytwarzane przez retikulum endoplazmatyczne. Około 50 różnych enzymów, znanych jako hydrolazy kwasowe, rozkłada białka, materiały genetyczne, polisacharydy, lipidy i organelle w procesie zwanym autofagią. Lizosomy przyłączają się do endosomu, tworząc kolejny lizosom, w którym trawi się materia. Otaczające lizosomy to warstwa błony komórkowej chroniąca resztę komórki przed ich wewnętrzną zawartością. Gdy materiały zostaną wystarczająco strawione, rozpraszają się przez błonę lizosomalną do cytoplazmy.
Warunki genetyczne, takie jak choroba Tay-Sachsa, mogą prowadzić do dysfunkcji tego systemu usuwania. Z powodu braku enzymu nagromadzenie niestrawionych makrocząsteczek staje się szkodliwe dla układu nerwowego i innych narządów.
