Komórki eukariotyczne mają organelle, struktury związane z błoną, które pełnią różne funkcje w komórce, a komórki prokariotyczne nie. Niektóre typowe organelli eukariotycznych obejmują jądro, mitochondria, rybosomy, aparaty Golgiego i chloroplasty.
Komórki eukariotyczne są bardziej zorganizowane i złożone niż komórki prokariotyczne. Eukariotyczny DNA znajduje się w jądrze, podczas gdy prokariotyczny DNA swobodnie pływa w cytoplazmie.
W latach 70. dr Lynn Margulis wysunął teorię, że organelle komórek eukariotycznych były kiedyś prokariotami, które zostały pochłonięte przez większe komórki. Większe komórki stały się gospodarzami, chroniąc mniejsze komórki, podczas gdy mniejsze komórki dostarczały pokarm swoim gospodarzom. Z czasem żaden nie mógłby istnieć bez drugiego. Ta endosymbiozyczna teoria została poparta dowodami, że organelle takie jak mitochondria i chloroplasty przypominają współczesne bakterie.
