Przegroda międzykomorowa dzieli lewą komorę od prawej komory, dzięki czemu utleniona krew nie jest mieszana z odtlenioną krwią. Bez tego oddzielenia organizm nie byłby w stanie uzyskać poziomu tlenu, który jest mu potrzebny na utrzymanie. Przegroda przyczynia się również do kształtu i struktury serca.
W sercu komory są odpowiedzialne za dostarczanie organizmowi krwi bogatej w tlen. Większa lewa komora pompuje krew do większej części ciała, podczas gdy prawa komora wysyła krew do płuc. Jeśli natleniona krew z lewej komory miałaby się mieszać z odtlenioną krwią z prawej komory, integralność i skuteczność systemu byłaby zakłócona, uniemożliwiając organizmowi otrzymanie wystarczającego zaopatrzenia w tlen.
Przegroda pełni rolę oddzielenia dwóch komór. Wykonany jest głównie z grubych mięśni. Jest pochylony do tyłu i na prawo. Jego prawy łuk tworzy część komory prawej komory.
Górna część przegrody oddziela przedsionek aorty od prawego przedsionka. Ta część ma wysoce włóknistą strukturę.
Wada przegrody międzykomorowej jest zaburzeniem charakteryzującym się otworem w przegrodzie. Najczęściej występuje u noworodków.
