Wartość pH w jelicie cienkim wzrasta z pH 6 w dwunastnicy do pH 7,4 na dystalnym końcu jelita cienkiego w końcowym odcinku jelita krętego. Wartość pH obniża się do wartości 5,7 w kącie jelita ślepego, ale wzrasta do pH 6,7 w odbytnicy.
Najbardziej kwaśną częścią ludzkiego odcinka przewodu pokarmowego jest żołądek, który na ogół znajduje się w pobliżu pH 1 do pH 3. Wysoka kwasowość w żołądku zwalcza bakterie, które są spożywane z pokarmem. Wraz ze wzrostem odległości od żołądka stopniowo wzrasta poziom pH. Jelito grube ma pH 5,5 do pH 7.