Przejście przez jelito trwa około pięciu do siedmiu godzin, chociaż całkowity czas transportu może się nieznacznie różnić w zależności od osoby. W jelicie cienkim występuje większość procesów trawiennych . Ilość i rodzaje jedzenia, jakie osoba spożywa, mogą drastycznie wpłynąć na czas, jaki pokarm musi przejść przez jelito cienkie.
Jelito cienkie trawi żywność chemicznie, wydzielając chemikalia, które rozkładają pokarm. Po zepsuciu jedzenia małe naczynia krwionośne, które wyścielają jelito cienkie, absorbują składniki odżywcze. Co ciekawe, jedzenie przez jelita grubego trwa znacznie dłużej niż w jelicie cienkim, mimo że jelita cienkie są znacznie dłuższe. Według badań przeprowadzonych w latach osiemdziesiątych w klinice Mayo, przejście pokarmu przez jelito trwa zwykle około 40 godzin.
Po zjedzeniu jedzenia przechodzi ono przez jamę ustną, przełyk i żołądek przed dotarciem do jelita cienkiego. Po tym, jak jelito cienkie wyekstrahowało większość wartości odżywczych z pokarmu, wysyła je do jelita grubego. W jelicie grubym woda jest pobierana z płynu i powstaje stolec. Ostatecznie stolec jest eliminowany przez odbyt.