Substancja molekularna jest najmniejszą częścią, w którą można dzielić substancje bez utraty ich właściwości. Powstaje, gdy dwa lub więcej atomów tworzy wiązanie chemiczne. W zależności od liczby różnych atomów tworzących cząsteczkę, można ją zaklasyfikować jako pierwiastek lub związek.
Cząsteczki są niewidoczne dla oczu. Są to najmniejsze cząstki, które zachowują fizyczne i chemiczne właściwości substancji. Sama cząsteczka składa się z atomów, nawet mniejszych jednostek, których struktura i interakcja umożliwiają tworzenie wiązań. Wiązania kowalencyjne nie rozpadają struktury molekularnej. Uważa się, że cząsteczki są w ciągłym ruchu, chociaż rodzaj ruchu zależy od substancji.
Różne rodzaje cząsteczek nie są takie same. Ich rozmiar zależy również od atomów, które je tworzą. Gdy cząsteczka składa się z dwóch lub więcej atomów tego samego rodzaju, nazywa się ją pierwiastkiem. Z drugiej strony, związek jest cząsteczką utworzoną przez dwa lub więcej różnych atomów. Elementy są dalej podzielone na dwie kategorie. Dwuatomowe cząsteczki składają się tylko z dwóch atomów, podczas gdy wieloatomowe składają się z co najmniej trzech składników. W pojedynczej cząsteczce może być ponad tysiąc atomów.