Zapylanie wody występuje, gdy pyłek dryfuje po wodzie, aby bezpośrednio kontaktować się z kwiatami, umożliwiając w ten sposób rozmnażanie niektórych roślin. Zgodnie z US Forest Service roślinami, które wykorzystują ten rodzaj zapylania są chwasty wodne i chwasty oczne. . Nazwa techniczna zapylenia wodnego jest hydrofilna powierzchniowo.
Zapylanie wody działa z powodu prądów wodnych przenoszących pyłki na rzekach lub jeziorach. Kwiaty uwalniają pyłki, a ziarna pasywnie płyną do innego kwiatu. Czasami pyłek wędruje pod wodą, aby wykiełkować. Ta bardzo skomplikowana metoda rozmnażania działa na roślinach tego samego gatunku. Kwiaty muszą wytwarzać dużo pyłku, aby zwiększyć ich szanse na rozmnażanie się roślin.
Zapylanie wody jest rzadkie, ponieważ większość roślin kwitnących owady lub wiatr. W Stanach Zjednoczonych rośliny zapylane wodą są uważane za inwazyjne, ponieważ rośliny te zwykle występują w Australii. Rośliny, które wykorzystują wodę do zapylania, nie muszą zużywać dużo energii, wytwarzając jasne kolory lub zapachy, aby przyciągnąć owady do reprodukcji.
Zapylanie powoduje, że genetycznie unikatowe nasiona w kwiatach zapewniają zróżnicowanie. W ten sposób potomstwo rośliny ma większe szanse na przetrwanie drastycznych zmian środowiskowych. Lepsze zróżnicowanie w czasie prowadzi do lepszej selekcji ewolucyjnej w stosunku do dużych populacji.