Zygota jest wynikiem połączenia komórki jajowej (komórki jajowej) i plemnika. Pozostaje zygotą, dopóki nie zacznie się dzielić; w tym momencie zygota staje się zarodkiem.
W organizmach wielokomórkowych zygota jest pierwszym etapem rozwoju po zapłodnieniu. W przeciwieństwie do komórki jajowej i plemników, z których każda zawiera połowę liczby chromosomów znalezionych w komórkach somatycznych, zygota zawiera pełną liczbę chromosomów prawidłowych w komórkach somatycznych gatunku. Zygota zwykle rozwija się w pojedynczy zarodek. Jeśli komórki potomne będące wynikiem podziału zygoty są rozdzielone, każda komórka może rozwinąć się w zarodek, w wyniku czego powstają bliźnięta jednojajowe.