Największym czynnikiem przyspieszającym specjację jest geograficzna izolacja populacji. Gdy pojedynczy gatunek jest podzielony na dwie lub więcej grup, tak aby członkowie jednej grupy nie mogli się rozmnażać z innymi, to pozwala każdej grupie na ewoluują niezależnie i ostatecznie stają się odrębnymi gatunkami.
Chociaż uważa się, że izolacja geograficzna leży za większością specjacji, istnieją okoliczności, w których nowe gatunki powstają z populacji bez większych odległości lub innych fizycznych podziałów między członkami. W tym przypadku uważa się, że jedna część populacji zmienia nawyki, takie jak pasożyty zaczynające atakować nowego żywiciela, a ten podział zachowania prowadzi do specjacji.
