Komórki bakterii mają organelle, chociaż generalnie są one mniej liczne i mniej skomplikowane niż te występujące u roślin i zwierząt. Najczęściej bakterie zawierają rybosomy. Organelle te składają się z granulek bogatych w RNA, znajdujących się w cytoplazmie i są miejscem syntezy białek.
Komórki bakterii składają się inaczej niż rośliny i zwierzęta. Brakuje im jądra i większości innych organelli związanych z błoną, z wyjątkiem rybosomów. Komórka bakteryjna ma podstawowe ciało, które pozwala mu się obracać, a większość ma membranę na zewnątrz ściany komórkowej. Komórki bakterii zawierają DNA umiejscowione w cytoplazmie.
Inne organelle mogą zawierać wić i pilus. Wąwóz bakterii służy do przemieszczania się. Pili pozwalają bakteriom przenosić DNA i trzymać się powierzchni.